Ο ασταθής κύκλος μπορεί να είναι αιτία υπογονιμότητας αλλά και μιας ανεπιθύμητης εγκυμοσύνης, αφού δεν είναι δυνατό να υπολογιστεί η ημέρα της ωορρηξίας.